いや判明、と言ってもCSSバグリスト@CSSバグ辞典スレッドから探してきただけですが。
高さが指定された要素内にあるインライン要素にパディングやボーダーが指定されているとき、パディングやボーダーの親要素をはみ出している部分が消えてしまう。


とのこと。具体的な解説は先方のページを見てもらうのが分かりやすいかと。